R语言中如何处理marker 不显著的cluster

Question

marker基因不显著的cluster如何处理呢，可以删除吗，删除的话用什么代码呢

Answer 1

以下答案由GPT-4.0Plus大模型与博主A努力中.......共同编写：
marker cluster是地图可视化中常用的技术,用于在标记密集的区域实现聚类显示,避免过度标记导致的视觉混乱。
在R语言中,有两个主要的地图可视化包leaflet和ggmap实现marker cluster。但是在某些情况下,marker cluster的效果可能不够显著,主要有以下几个原因:

1. 聚类距离(clusterRadius)设置过小。clusterRadius决定了同一聚类中的两个marker之间的最大距离,如果设置过小,marker之间的距离小于该值,则无法实现聚类效果。
2. 缩放级别(zoomLevel)设置过大。在较高的缩放级别下,由于屏幕显示面积减小,marker之间的距离相对变大,这会影响聚类效果。
3. marker数量太少。如果marker数量较少,每个marker之间的距离就较大,这也会导致聚类效果不明显。
4. 部分marker位置偏差较大。当大部分marker位置较聚集,少部分marker位置偏离较远时,偏离部分的marker无法参与聚类,影响效果。
   所以,解决这个问题,可以尝试:
5. 适当增大clusterRadius,扩大每个聚类包含的marker范围。
6. 选择适当的缩放级别,不至于影响marker之间的距离判断。
7. 增加marker的数量或密度。
8. 检查marker位置,剔除位置偏差过大的marker。
   除此之外,也可以选择其他参数,如:

• spiderfyOnMaxZoom:最大缩放级别启用spiderfy(蜘蛛网)效果,避免marker重叠。
• showCoverageOnHover:悬停在聚类上显示聚类里所有marker。
  这些参数的设置也有助于提高聚类的显著性与友好度。
  总的来说,实现marker cluster要考虑的因素较多,需要根据数据的特征选择适当的算法参数。