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- 2024-09-10 00:03生信摆渡的博客 听说你的使用getGEO经常有网络问题？一行代码解决下载GEO表达谱和临床数据
- 2024-09-10 13:05JOU金牌码农的博客 利用GEOquery进行数据下载遇到的超时问题
- 2024-07-10 15:24邢博士谈科教的博客 研究人员可以在该平台上查找、下载和分析各种基因表达数据集，以便进行生物信息学和生物医学研究。NCBI GEO数据库提供了丰富的数据资源和分析工具，是生命科学领域的重要研究工具之一。大量生物医学领域发表的论文...
- 2022-08-27 00:33MrCharles的博客 没办法，试了很多，只能自己手动下载。
- 2024-04-05 20:04Yettah的博客 请问这个是这个是什么问题？
- 2021-05-12 17:45weixin_39843093的博客 Bioconductor的GEOquery几个常用函数可以实现GEO数据的下载，但有时候我想直接通过终端下载而不是使用Rstudio然后运行脚本的方式，所以下面用shell脚本对GEOquery两个下载函数getGEO()以及getGEOSuppFiles()进行了...
- 2021-05-12 13:34PableetoX的博客 Bioconductor的GEOquery几个常用函数可以实现GEO数据的下载，但有时候我想直接通过终端下载而不是使用Rstudio然后运行脚本的方式，所以下面用shell脚本对GEOquery两个下载函数getGEO()以及getGEOSuppFiles()进行了...
- 2020-04-03 22:59嘚嘚鸟的博客 GEO数据下载：网页下载和使用GEOquery包 GEO数据库里的数据是免费的，可以直接在线下载。但是，在下载数据之前你要了解GEO数据库的4个概念和4个数据存放类型： GSE数据编号(Series) GPL数据编号(GEO platforms) GSM...
- 2024-11-09 17:07生信摆渡的博客 我相信，应该能够解决99%的GEO探针注释问题
- 2017-07-16 22:36weixin_30311605的博客 最近需要下载一大批GEO上的数据，问题是我要下载的Methylation数据根本就没有sra文件，换言之不能使用Aspera之类的数据进行下载。但是后来我发现了GEOquery这个不错的R包，不知道是网络问题还是怎么，GEOquery有时候...
- 2024-05-17 23:29遗落凡尘的萤火-生信小白的博客 From 生物技能树 GEO数据挖掘第二节。
- 2024-05-16 15:33遗落凡尘的萤火-生信小白的博客 1.图表分析 ...4.复杂数据分析 提示：这是GEO数据挖掘的大概内容： 广义的基因有 6w+个，如何缩小范围到课题相关？ 1.数据从哪里来 2.有什么类型的数据可挖掘 基因表达芯片 转录组 单细胞 突变
- 2024-10-26 14:46拉布拉多--奶芙的博客 exp1 = trans_array(exp1,ids1) #exp1本来是探针矩阵 exp2 = trans_array(exp2,ids1) }#需要将探针注释转变为基因注释时再使用 #(4)合并表达矩阵 # exp2的第三个样本有些异常，可以去掉或者用normalizeBetweenArrays...
- 2023-10-08 12:37感性逻辑的博客 由于网络原因，常常使用getGEO函数可能会出错，下载不了文件。可以从GEO官网下载矩阵（部分可能没有矩阵）然后进行R读取进行ID转换分析等。
- 2017-02-26 11:01Joshua_HIT的博客 最近需要下载一大批GEO上的数据，问题是我要下载的Methylation数据根本就没有sra文件，换言之不能使用Aspera之类的数据进行下载。但是后来我发现了GEOquery这个不错的R包，不知道是网络问题还是怎么，GEOquery有时候...
- 2023-08-16 08:27YZJenny的博客 问题：想下载GPL24676的基因注释文件，通过（1）GEO网页（2）gpl
- 2021-03-09 02:34暮商翌的博客 如何高效地把JSON数据转换成实际的Java类对象，就是本文要说明的问题。写一个操纵JSON数据的Java程序，通常代码会重度依赖于JSON API，你总是需要对JSON数据进行反序列化，再转换成原生Java对象。整个过程大致如下：...
- yqchg的博客 一开始都说是R语言的版本太高，要用3.几，但是最终下载了切换了也没有作用 废话不多说，就一句代码 有没有想过，有一些是需要在BiocManager中下载呢： BiocManager::install("multtest") 如下图：成功 自己弄了一...
- 2024-01-20 20:53optiz的博客 下载探针矩阵probe.txt和平台注释ann.txt查看分组信息，复制对照组样本名称s1.txt和实验组样本名称s2.txt。
- 2021-12-11 00:45圣杯之旅 P.Z. Gao的博客 做了一个GPL6466平台的芯片数据处理。没找到辅助R包，用clusterProfiler包和GPL文件做了ID转换。并进行了后续处理
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问题事件
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6月11日
创建了问题
6月3日