train 函数的 method

Question

冒昧的问一下
R 语言中 caret 包支持很多种模型
那么使用 train 函数进行交叉验证时，最适合 cox 生存模型的 method 是哪一种呀?
首先感谢您的回答！

Answer 1

TechWhizKid参考GPT回答：

• 在R语言的caret包中，使用"survival"库中的"coxph"函数可以进行Cox比例风险模型（也称为Cox生存模型）的分析。在进行交叉验证时，可以选择以下方式进行：

library(caret)
library(survival)

# 设置训练控制参数，用于交叉验证
trControl <- trainControl(method = "cv", number = 10, summaryFunction = twoClassSummary, classProbs = TRUE)

# 使用train函数训练模型
model <- train(Surv(time, status) ~ ., data = yourData, method = "coxph", trControl = trControl)

• 上面的代码将使用10折交叉验证来训练Cox生存模型，其中yourData是你的数据集，time和status分别是生存时间和状态变量。你需要将其替换为你自己的数据。

• Cox生存模型的训练通常涉及到一些特殊的问题，如右删失（即部分个体在观察期结束时还没有发生感兴趣的事件）和协变量的选择。这要你根据实际问题和数据来确定适合的方法。

• 另外，交叉验证在生存分析中可能不像在其他类型的模型中那样直观，因为我们不能简单地将数据集随机划分为K个等份。一种常见的方法是使用时间相关的分割，但这需要根据实际数据来确定。