qq_45079877 2023-07-05 16:03
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已结题

金属蛋白力场如何构建

用NAMD进行金属蛋白(pdb code :1mey)的模拟操作,
查到了含金属的的top文件(top_all22_prot_metals.inp和par_all22_prot_metals.inp)生成psf,但是在能量最小化和能量平衡修改配置文件的时候锌离子不知道怎么处理。考虑过使用amber,但是导师希望我用NAMD来进行操作,请问一下要怎么构建金属力场文件呢?

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