R语言；TCGA肝癌数据库

Question

哪位帮忙下啊，TCGA肝癌数据库
我有个TIDE的frame，是图1这样，我想用gsub提取“-”的前3项，比如TCGA-DD-AAVQ-01A-11R-A41C-07截取成TCGA-DD-AAVQ
代码如下：
row.names(tide)=gsub("(.?)\-(.?)\-(.?)\-(.?)\-.*","\1\-\2\-\3",row.names(tide))

可是报错了> row.names(tide)=gsub("(.?)\-(.?)\-(.?)\-(.?)\-.*","\1\-\2\-\3",row.names(tide))
Error in .rowNamesDF<-(x, value = value) : 不允许有重复的'row.names'
好像是有重复的行，请问如何解决啊？

Answer 1

先给你的数据添加一个唯一的编号作为行名，然后用make.unique函数来处理重复的行名就可以了