关于#RAxML#的问题，如何解决？

Question

在使用RAxML以最大似然法构建系统发育树时报错，问题如下：
Error character / not allowed in run ID
raxmlHPC-PTHREADS-AVX: axml.c:5511: analyzeRunId: Assertion `0' failed.
请问应该如何调整？

Answer 1

不知道你这个问题是否已经解决, 如果还没有解决的话:

• 以下回答由chatgpt基于相关博客总结生成:

  首先，这个错误提示表明在运行RAxML时，运行ID中不能包含字符 "/ "，因此，我们需要修改运行ID来解决这个问题。

  下面是解决此问题的具体步骤：

  1. 打开您正在运行RAxML的命令行终端窗口。

  2. 查看您当前正在使用的RAxML命令，确认是否在命令中设置了运行ID。例如：

  raxmlHPC-PTHREADS -s alignment.fasta -n runID -m GTRGAMMA -p 12345 -# 100

  1. 确认上述命令中的运行ID的值是否包含字符 "/"，如果有，请将其移除或更改为有效的字符。例如，将运行ID修改为 "runID123"。

  2. 修改完成后，再次运行您的RAxML命令，确保修改后的运行ID没有包含非法字符。

  这些步骤应该可以解决您遇到的问题。

  如果您在执行上述步骤后仍然遇到问题，请确保您对RAxML的参数和命令的正确使用和配置。如果问题持续存在，建议您提供更多相关信息，例如完整的RAxML命令和其他相关配置，以便更好地诊断并解决您的问题。

  注意：以上解决方案是基于对问题描述的理解，如果有任何误解，请提供更多详细信息，以便能够给出更准确的解决方案。

如果你已经解决了该问题, 非常希望你能够分享一下解决方案, 写成博客, 将相关链接放在评论区, 以帮助更多的人 ^-^