linux中运行python命令、py脚本

Question

目前我有一个py脚本，test.py，在linux中运行时：
python3 test.py data1.csv data2.tab data3.txt output.txt
data1.csv、data2.tab和data3.txt是已知数据，运行期间没报错，但是最终的output.txt文件是空的，如何解决呢？
以下是test.py文件：

import sys
 
nr_cog = sys.argv[1]
cog_tab = sys.argv[2]
blast = sys.argv[3]
output = sys.argv[4]
 

nr = {}
 
nr_cog = open(nr_cog, 'r')
for line in nr_cog:
    line = line.split(',')
    if line[2] not in nr:
        nr[line[2]] = [line[6]]
    elif line[6] not in nr[line[2]]:
        nr[line[2]].append(line[6])
 
nr_cog.close()
 

cog = {}
 
cog_tab = open(cog_tab, 'r')
for line in cog_tab:
    line = line.split('\t')
    cog[line[0]] = '\t'.join(line[0:3])
 
cog_tab.close()
 

output = open(output, 'w')
blast = open(blast, 'r')
print(f'{blast.readline().strip()}\tCOG_name\tCOG_class\tCOG_description', file = output)
 
for line in blast:
    line = line.strip()
    id = line.split('\t')[5]
    if id in nr:
        for id2 in nr[id]:
            print(f'{line}\t{cog[id2]}', file = output)
 
blast.close()
output.close()

Answer 1

• 看起来，不应该空哦，第一条print() 的字符串都没有写入output么？我没有看到您的数据，不敢妄加推测。

• 我复刻您的代码逻辑，可以正常写入文件的啊😜
  代码运行效果截屏图片
  

  

Python代码

#!/sur/bin/nve python
# coding: utf-8
import time 

filename = '/sdcard/Documents/001test.txt'
date = time.localtime()
year, month, day, hour, minute = date[:5]
f = open(filename, 'w')
print(f"{year}-{month:0>2}-{day:0>2} {hour:0>2}:{minute:0>2}", file=f) # 写入日期时间。

for i in range(9):
    print(f"{i+1}. 测试", file = f)

f.close()

print() # 打印输出文件内容。

for i in open(filename):
    print(i.strip()) 

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