DEseq2包安装不上

Question

求解DEseq2包总是安装不上，出现图中报错信息。总是说版本不符合，已将r与rstudio都更新至最新版本，甚至还卸载了重装，都不行，有没有仙男仙女下凡讲解一下啊

Answer 1

引用 皆我百晓生 小程序回复内容作答：

抱歉您遇到了安装DESeq2包的问题。根据您提供的报错信息，看起来是R版本不兼容导致的问题。

DESeq2包要求R的版本在3.5或更高。您可以使用以下步骤解决这个问题：

1. 确保您的R和RStudio已经安装在最新版本。您可以通过以下命令在R或RStudio中检查版本：

R.version.string

确保返回的版本号大于等于3.5。

1. 如果R和RStudio的版本都已更新，但问题仍然存在，请尝试进行以下操作：

• 确保您的R包管理器已配置为从正确的镜像源下载软件包。可以尝试更改镜像源，例如选择一个国内的R镜像源。

• 使用以下命令手动安装DESeq2包：

install.packages("DESeq2")

• 如果上述命令无法安装DESeq2包，请尝试使用BiocManager包来安装DESeq2。先尝试从CRAN安装BiocManager包：

install.packages("BiocManager")

然后使用以下命令安装DESeq2包：

BiocManager::install("DESeq2")

• 如果以上尝试都不成功，可能是由于其他配置问题导致。您可以尝试重启R或RStudio，并尝试运行install.packages("DESeq2")或BiocManager::install("DESeq2")命令。

如果您仍然无法成功安装DESeq2包，建议您检查您的系统环境配置以及安装过程中的任何其他错误信息，如果可能的话提供更具体的错误信息以便我们更好地帮助您解决问题。