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2301_76980004
2023-09-05 14:47
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编程语言
已结题
DEseq2安装失败
r语言
在安装时一直出现这个问题,这个是啥意思?能解答一下吗?
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存在每次library(
DES
eq2
)不能够
r语言
2023-03-29 10:14
回答 1
已采纳
跟着报错来,提示zlibbioc,genomicranges两个包,检查一下在不在。看到你GenomicRanges下了,检查看看能不能library BiocManager::install("zl
singleR
安装
报错 "use `force = TRUE` to re-install",如何解决?
r语言
2023-02-06 11:08
回答 3
已采纳
该回答引用ChatGPT请参考下面的解决方案,如果有帮助,还请点击 “采纳” 感谢支持! 这个报错信息告诉你,在你
安装
SingleR 包时,它已经
安装
了与当前版本相同或更高版本的版本。 如果你仍然希
R语言package问题,请教兄弟姐妹们
r语言
2023-03-08 16:15
回答 1
已采纳
尝试在使用 BiocManager::install("
安装
包 ",force=TRUE)
R语言
安装
DES
eq2
包
2022-09-09 11:14
Hikmatkar的博客
简单的说——
DES
eq2
将对原始reads进行建模,使用标准化因子(scale factor)来解释库深度的差异。然后,
DES
eq2
估计基因的离散度,并缩小这些估计值以生成更准确的离散度估计,从而对reads count进行建模。此函数的目的...
在做两两比较分析时遇到报错,请问如何解决
r语言
2022-05-15 22:21
回答 1
已采纳
已解决,pvalue中p大写
关于
安装
DES
eq2
的错误,不存在GenomeInfoDbData
2022-02-24 02:25
suiyue17的博客
今天想用
DES
eq2
来分析rna-seq的数据,然后死活安不上这个R包,老是提示这样的错误。 在网上试了各种方法都行不通,包括install.packages,和下载R包后自己手动
安装
都无法解决,当我使用这两个方法后,他会提示这个...
求助帖:Rstudio如何
安装
DES
eq2
2024-06-11 20:16
yuhanxianchou的博客
已经尝试了卸载重装R,删除C盘的R相关文件,换镜像,从GitHub下载,也出现了下面这个。用BiocManager
安装
DES
eq2
时, 最后一步总是出现这个,是什么原因导致的。
DES
eq2
包的
安装
2021-03-20 18:37
冬猫TwT的博客
DES
eq2
包的
安装
心路历程1.缺少RTools1.1RTools下载1.2RTools40环境配置1.2.1创建一个Renviron文件:1.2.2然后在文件里面写:1.2.3保存Renviron,关闭RStudio重新打开1.2.4输入下方语句,检查是否配置成功2.使用...
des
eq2
_project
2021-04-08 02:46
des
eq2
_project先决条件的Python 3 迷你conda蛇纹R包
DES
eq2
tximportData tximport 读卡器ggplot2 dplyr 量具gageData 路径视图注释Dbi org.hs.eg.db RColorBrewer 秘籍图增强火山clusterProfiler 生物基质边缘R ...
DEs
eq2
和edgeR的
安装
问题记录
2022-05-03 00:16
心如止水-WTF的博客
DEs
eq2
和edgeR
安装
问题记录
DEs
eq2
和edgeR 是常用的差异分析的R包,不过在
安装
时往往会碰到一些依赖包装不上。
安装
命令: #在R 的交互命令行运行 if (!require("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages(...
R语言——基于
DES
eq2
做基因表达差异分析
2022-10-28 20:11
bobo JLU的博客
本记录主要是使用
DES
eq2
包进行差异包表达分析。...我们采用的是BiocManager
安装
DES
eq2
包。检查数据Counts文件与coldata数据是否匹配。注意部分依赖包是由R4.2.1建造,可能会有问题。过滤在所有重复样本中小于1的基因。
salmon_
des
eq2
_snakemake:该存储库具有用于鲑鱼
Des
eq2
管道的snakemake脚本,用于RNAseq数据分析
2021-05-14 23:11
Salmon-
DES
eq2
和Salmon-Wasabi-Sleuth管线进行RNAseq数据分析通过Salmon-
DES
eq2
和Salmon-Wasabi-Sleuth管道进行RNAseq数据分析可在此处进行。 RNAseq数据可从。 工作流程使用snakemake库。
r语言degs
eq2
_R语言
DES
eq找差异基因
2020-12-23 10:48
浈浈带你走进无人驾驶的博客
biocLite(“
DES
eq”)即可,如果
安装
失败
,就需要自己下载源码包,然后
安装
R模块。二.所需要数据它的说明书指定了我们一个数据source(“http://bioconductor.org/biocLite.R”);biocLite(“pasilla”)
安装
了pasil...
解决win7系统下
DES
eq2
包
安装
2024-08-20 09:54
颖川初恋的博客
现在RStudio官网的版本只适用于win10/11,win7只能
安装
较低版本的RStudio,由于版本较低,会导致BiocManager包无法使用,因此需要手动添加配置文件config.yaml。接着在R
安装
目录下添加config.yaml文件,将整个代码...
求助
DES
eq2
安装
问题
2023-02-13 01:14
2301_76497647的博客
求助
DES
eq2
安装
问题
DES
eq2
.R
2023-12-15 12:34
DES
eq2
.R
r语言degs
eq2
_R语言
DES
eq 包介绍 -
2020-12-23 10:48
ClimberSeven的博客
R语言
DES
eq包介绍分析RNA序列数据的一个主要任务是探测基因的差异表达,
DES
eq包提供了测试差异表达的方法,应用负二项分布和收缩的分布方程估计。1. 包的
安装
输入如下命令,
DES
eq和相关的包就可以自动下载和
安装
。 &...
RStudio
安装
DES
eq2
2019-12-27 11:36
little^raccoon的博客
第一次用R… R version 3.6.2 install.packages("BiocManager") BiocManager::install(version = "3.10") BiocManager::install("
DES
eq2
") library("
DES
eq2
") 上路
rna-dge-salmon-
des
eq2
:使用Salmon,tximport和
DES
eq2
对FastQ文件执行差异分析
2021-02-15 22:20
本教程将详细讲解如何利用Salmon、tximport和
DES
eq2
这三个工具对FastQ文件进行差异表达分析。FastQ文件是RNA-seq实验后生成的原始数据,包含了测序得到的碱基序列。 首先,Salmon是一款快速、准确的转录本定量工具...
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