GRS多基因风险评分计算

Question

我想计算多基因风评分，使用的是UK Biobank的数据。然后用的是这个公式：weighted genetic risk score = (b1 x SNP1 + b2 x SNP2 + ... bn x SNPn) x
(n/sum of the b coefficients). 这里SNP代表的是风险等位基因的数量。我想知道的是这个等位基因数量是怎么下载的？或者从哪里可以查到？我在
UKB官网看了一圈都没有找到。就是下图标黄的数据。

Answer 1

对于UK Biobank数据中的SNP等位基因数量，你可能需要查阅具体的研究或数据集文档来获取。这些信息通常会以表格的形式提供，列出了每个SNP的基因型和相应的风险等位基因数量。

以下是查询SNP等位基因数量的常见方法：

1. 查看数据发布声明或相关研究论文：这些资源通常会提供有关数据集的详细说明，包括SNP等位基因数量的信息。你可以通过搜索UK Biobank的相关论文或访问其官网来查找这些信息。
2. 使用数据浏览器或在线工具：有些在线资源允许你直接查询SNP等位基因数量。你可以搜索"UK Biobank SNP genotype data browser"或类似的关键字，找到相关的数据浏览器或在线工具。
3. 联系数据提供者：如果你无法通过上述方法找到所需的信息，可以尝试与UK Biobank或相关研究团队联系，询问有关SNP等位基因数量的详细信息。

请注意，由于UK Biobank数据涉及个体基因组信息，访问和使用这些数据可能需要适当的授权和许可。确保你在合法和合规的范围内进行查询和使用。