R语言 运行速度慢 运行内存不够

Question

各位友友们，我现在对R的一些问题充满困惑，有懂这方面的友友可以给我提些建议吗。十分感恩和感谢
因为我跑一个代码需要15小时左右，我最开始开了很多窗口一起跑，但发现内存不够。所以就根据网友们的意见尝试了很多其它的方法。①释放虚拟内存；②把更多的内存分配给R；③使用循环④parallel并行处理多核计算；⑤少开一些窗口，使用后台运行。其中只有③和④因为尝试后发现运行结果过慢，最后选择了放弃。
因为没有用循环，我就是每次一个代码运行完了，手动修改，然后运行下一个代码。但是目前出现了两个问题：
①我最开始能开4个窗口，然后使用后台运行，相当于我能一次跑8个代码。但越到后面，我开的窗口就越少了，因为会报错或者闪退，我想知道原因是什么，我能怎么改变
②我跑一个代码的时间消耗的时间更久了，以前只需要15小时，现在需要1天，两天甚至三天，我想知道原因是什么，我能怎么改变

Answer 1

问题 1：窗口数量减少导致报错或闪退

这可能是由于计算资源不足或内存泄漏导致的。

1. 内存释放： 确保每个代码运行完后释放所有占用的内存。在R中，你可以使用gc()函数进行垃圾回收。

2. 监控内存使用： 使用R中的工具（如profmem包）来监控每个代码块的内存使用情况，以便及时发现潜在的问题。

3. 减少并发运行： 降低并发运行的窗口数量，确保每个代码块有足够的内存和计算资源。

4. 查看错误信息： 当报错或闪退时，查看相关的错误信息，这可能有助于定位具体的问题。

问题 2：代码运行时间变长

这可能是由于算法复杂度增加、数据量增大或代码中存在效率低下的部分。

1. 代码优化： 优化你的R代码，确保它在运行时能够更有效地利用资源。使用R的一些优化技巧，如向量化操作，可以提高代码运行效率。

2. 并行计算： 考虑重新尝试并行计算，但调整并行度以避免性能下降。

3. 算法优化： 如果可能的话，检查你的算法，看看是否有更有效率的实现方式。

4. 数据处理： 确保你的数据处理流程也是高效的，避免不必要的复杂性。

5. 日志记录： 在代码中添加日志记录，以便追踪每个代码块的运行时间，帮助你找到效率低下的部分。