参数1不是矢量(标签-MR|关键词-Sam)

Question

> #设置工作目录
> setwd("D:\\MRi")
> #读入数据包
> library(TwoSampleMR)
TwoSampleMR version 0.5.8 
[>] New: Option to use non-European LD reference panels for clumping etc
[>] Some studies temporarily quarantined to verify effect allele
[>] See news(package='TwoSampleMR') and https://gwas.mrcieu.ac.uk for further details

> ########################IEU在线提取数据MVMR###########################
> id_exposure <- c("finn-b-H8_VESTIBNEUR","finn-b-H8_BPV","finn-b-H8_PERIPHVERTIGO") # 三个暴露分别是HDL cholesterol，LDL cholesterol和Triglycerides
> id_outcome <- "EBI-A-GCST90026654"  #定义结局变量ID
> exposure_dat <- mv_extract_exposures(id_exposure)  #三个显著相关的SNP提出
API: public: http://gwas-api.mrcieu.ac.uk/
Error in order(temp$pval.exposure, decreasing = FALSE) : 参数1不是矢量

参数1不是矢量，请教这怎么解决啊

Answer 1

引自免费微信小程序：皆我百晓生

在R语言中，order()函数需要一个向量作为参数来对元素进行排序。根据您提供的错误信息，temp$pval.exposure似乎不是一个矢量（vector）。在使用mv_extract_exposures()函数从IEU GWAS数据库提取数据时，该函数可能没有正确地返回包含p值的矢量。

为了解决这个问题，请确保：

1. mv_extract_exposures()函数成功执行并返回了预期的数据结构。
2. 检查函数返回的对象exposure_dat或其内部组件是否确实包含了SNP的暴露效应p值，并且这些p值是以矢量形式存储的。

如果API调用失败或者返回的数据结构不正确，您需要检查输入ID的有效性以及网络连接和API服务的状态。此外，可以查阅TwoSampleMR包的文档以获取更详细的说明或示例代码，看看如何正确处理返回的数据对象。