为什么我的cibersort一直报错呀？
我的r是4.3.2的 help
cibersort包
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关注这里如报错内容已经告诉你啦，重新安装一下preprocesscore包，版本不对
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- 2023-03-03 18:45回答 1 已采纳 该回答引用ChatGPT 根据您提供的信息，看起来您正在使用R语言和CIBERSORT软件进行细胞免疫浸润分析。根据错误信息，“mixture_file”文件中存在重复的行名称，这会导致R无法读取该
- 2021-07-21 15:48回答 1 已采纳 找不到对应路径的文件，改为绝对路径访问。
- 2019-11-24 20:44回答 2 已采纳 注意一下文件名称。之前使用read.table()读取txt文件时，文件命名为".txt",存储为.txt格式，所以真正的文件名".txt.txt"
- 2021-08-20 19:50https://blog.csdn.net/weixin_52730798/article/details/118314284#comments_17996687这个帖子中的图的代码和数据
- 2022-02-22 11:30Cibersort的数据与代码
- 2022-04-18 18:4218kkk的博客 R语言CIBERSORT计算免疫浸润+Rproject的使用；包括自定义函数的方法或者下载包的方法
- 2022-08-28 16:20Kevin丶大牛的博客 CIBERSORT常见问题以及操作代码，数据可视化分析全过程。新手即可学会！
- 2022-07-26 15:57Kevin丶大牛的博客 学习CIBERSORT心得
- 2022-10-23 00:18生信小博士的博客 用于芯片表达矩阵和测序表达矩阵，对未知混合物...CIBERSORT同时提供R包和在线网页工具，可以对用户的表达矩阵进行非负矩阵分解后计算不同细胞类型的比例。网页版有LM22的参考数据集，只需要提供表达矩阵文件就可以了。
- 2021-04-23 10:18菠萝西斯的博客 文章目录CIBERSORT一、CIBERSORT是什么？二、计算原理2.读入数据总结 CIBERSORT CIBERSORT is an analytical tool from the Alizadeh Lab developed by Newman et al. to provide an estimation of the abundances ...
- 2022-04-24 16:45CrimsonUMO的博客 【生信笔记】R语言easier包对转录组数据进行免疫治疗响应的预测
- 2023-04-06 11:35可爱的一只帆的博客 CIBERSORT | 免疫浸润分析
- 2022-04-09 11:51qq_27390023的博客 CIBERSORT可以从bulk 基因表达数据估计混合细胞群中成员细胞类型的丰度。 CIBERSORT.R 代码 # CIBERSORT R script v1.04 (last updated 10-24-2016) # Note: Signature matrix construction is not currently ...
- 2021-05-14 00:47生信宝典的博客 Cibersort算法的纯代码实现及结果绘图展示 remove(list = ls()) #一键清空 #加载包 library(ggplot2) library(reshape2) library(ggpubr) library(dplyr) 1. Cibersort计算免疫细胞 加载cibersort的官方提供的源码...
- 2021-06-28 23:19彩虹色的朝阳的博客 最近在做cibersort浸润分析，在对结果做可视化的时候遇到一点问题 根据默认的绘图只能进行一组数据的绘制，而我想要的结果是不同组数据同时展示 就是这张图这种，然后在网上查了一下这个问题，虽然R语言相关的...
- 2022-05-20 05:08qqgzsws的博客 本研究描述的方法称为Cibersort，在线发表于三月三十日的《自然方法》（Nature Methods） 提出 CIBERSORT 的文章 Newman, Aaron M et al. “Robust enumeration of cell subsets from tissue expression profiles.”...
- 2023-08-15 16:11weixin_49320263的博客 R语言实现免疫浸润分析（1）
- 2022-10-08 17:52双仔宝贝的博客 R提示ERROR: dependencies ‘caret’ are not available for package ‘XXX’ 和MethylCIBERSORT的R包安装
- 2021-10-08 19:40CIBERSORT小鼠的免疫特征集
- 2022-05-16 09:58心有灵犀啦的博客 1.什么是饼图/甜甜圈图？ 在工作中如果遇到需要计算总... R语言怎么画饼图/甜甜圈图 3.1 饼图 # 加载R包，没有安装请先安装 install.packages("包名") library(graphics) # 读取饼图/甜甜圈图数据文件 df= read.delim(...
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