TS孟德尔，提取暴露因素数据库显示参数没有用参数没有用(opengwas_jwt = opengwas_jwt)

Question

在RStudio中，运行“bmi_exp_dat <- extract_instruments(outcomes = 'eqtl-a-ENSG00000145675')”，显示错误于ieugwasr::tophits(outcomes, pval = p1, clump = clump, r2 = r2, : 参数没有用(opengwas_jwt = opengwas_jwt) 请问这个怎么解决啊？

Answer 1

以下回复参考：皆我百晓生、券券喵儿等免费微信小程序作答:

这个问题似乎与R Studio环境有关，而不是特定的编程问题。opengwas_jwt可能是用于连接OpenWAS（开放基因组数据分析）服务的凭据。如果你正在尝试从OpenWAS获取数据，但遇到了错误，可能是因为你的环境配置或者权限设置有问题。

为了解决这个问题，你需要检查以下几个方面：

1. 确保你已经正确地设置了OpenWAS的服务凭证，并且这些凭证已经被R Studio所识别。

   • 在R Studio中，打开Settings -> Preferences -> Environment Variables。
   • 添加一个名为OPENWAS_JWT的变量，并输入正确的凭据。

2. 检查你的工作环境中是否已安装了OpenWAS的API包，以及如何正确导入它到R环境中。

3. 如果上述步骤都没有解决问题，可以考虑联系OpenWAS的技术支持团队，提供详细的错误信息以便他们进行诊断和修复。

至于代码中的opengwas_jwt，看起来是一个环境变量，其值是通过设置环境变量实现的。例如，在命令行中执行以下命令以添加此变量：

export OPENWAS_JWT="your_jwt_here"

然后，你可以将其作为函数调用来访问OpenWAS的数据。确保你在使用之前验证其有效性，因为不同的环境可能会有不同的凭据。

如果你能提供更多关于你试图解决的问题的细节，比如你在哪些部分遇到困难，或者你已经尝试过什么方法，我会更乐意帮你找到合适的解决方案。