数据合并报错怎么解决

Question

filename<-list.files()
data<-read.csv(filename[1])
for(i in 2:length(filename)){
  file<-read.csv(filename[i])
  data<-merge(data,file,by='subject_id',all=T)
  data<-data[!duplicated(data$subject_id),]
}

遇到问题报错
错误于make.names(col.names, unique = TRUE): 
  '<c4>Թ<a3>'多字节字符串有错误
此外: 共有11个警告 (用warnings()来显示)
> warnings()
警告信息：
1: In merge.data.frame(data, file, by = "subject_id", all = T) :
  column names ‘valueuom.x’, ‘valueuom.y’ are duplicated in the result
2: In merge.data.frame(data, file, by = "subject_id", all = T) :
  column names ‘valueuom.x’, ‘valueuom.y’ are duplicated in the result
3: In merge.data.frame(data, file, by = "subject_id", all = T) :
  column names ‘valueuom.x’, ‘valueuom.y’, ‘valueuom.x’, ‘valueuom.y’ are duplicated in the result
4: In merge.data.frame(data, file, by = "subject_id", all = T) :
  column names ‘valueuom.x’, ‘valueuom.y’, ‘valueuom.x’, ‘valueuom.y’ are duplicated in the result
5: In merge.data.frame(data, file, by = "subject_id", all = T) :
  column names ‘valueuom.x’, ‘valueuom.y’, ‘valueuom.x’, ‘valueuom.y’ are duplicated in the result
6: In merge.data.frame(data, file, by = "subject_id", all = T) :
  column names ‘valueuom.x’, ‘valueuom.y’, ‘valueuom.x’, ‘valueuom.y’ are duplicated in the result
7: In merge.data.frame(data, file, by = "subject_id", all = T) :
  column names ‘valueuom.x’, ‘valueuom.y’, ‘valueuom.x’, ‘valueuom.y’ are duplicated in the result
8: In merge.data.frame(data, file, by = "subject_id", all = T) :
  column names ‘valueuom.x’, ‘valueuom.y’, ‘valueuom.x’, ‘valueuom.y’ are duplicated in the result
9: In merge.data.frame(data, file, by = "subject_id", all = T) :
  column names ‘valueuom.x’, ‘valueuom.y’, ‘valueuom.x’, ‘valueuom.y’ are duplicated in the result
10: In merge.data.frame(data, file, by = "subject_id", all = T) :
  column names ‘valueuom.x’, ‘valueuom.y’, ‘valueuom.x’, ‘valueuom.y’ are duplicated in the result
11: In merge.data.frame(data, file, by = "subject_id", all = T) :
  column names ‘valueuom.x’, ‘valueuom.y’, ‘valueuom.x’, ‘valueuom.y’ are duplicated in the result

Answer 1

根据您提供的代码和错误信息，您在使用merge函数合并数据时遇到了一些问题。错误提示包含多字节字符串有错误，且还有关于重复列名的警告。

我们可以逐步修复这些问题。以下是具体的修改建议和原因：

1. 解决多字节字符串错误
   这个错误通常与文件内容的编码有关。您可以尝试使用read.csv时指定文件编码。例如，常见的编码包括UTF-8和UTF-8-BOM。可以这样修改：

data <- read.csv(filename[1], fileEncoding = "UTF-8") # 或者使用 "UTF-8-BOM"
2. 处理重复列名
在使用merge时，如果不同的文件中有相同的列名（例如valueuom），它们将被标记为valueuom.x和valueuom.y。这里有两种选择：

选择保留一列：在合并后，您可以选择保留某一列，而忽略另一列。
重命名列：在合并之前，可以通过重命名列来消除重复。
以下是修改后的完整示例代码，结合了上述建议：

# 获取当前文件夹下所有csv文件的名称
filename <- list.files(pattern = "\\.csv$", full.names = TRUE)

# 初始化数据，读取第一个文件，同时指定编码
data <- read.csv(filename[1], fileEncoding = "UTF-8")

# 循环读取剩余文件并合并
for (i in 2:length(filename)) {
# 读取文件
file <- read.csv(filename[i], fileEncoding = "UTF-8")

# 若要避免列名重复，可以根据需求重命名
# 例如: 下面这行重命名为 valueuom_new，这取决于实际的数据结构
names(file)[names(file) == "valueuom"] <- "valueuom_new"

# 合并数据
data <- merge(data, file, by = 'subject_id', all = TRUE)

# 删除重复的 subject_id 行
data <- data[!duplicated(data$subject_id), ]
}

1. 其他提示
   注意文件格式：在使用read.csv时，确保所有文件都是以CSV格式正确存储的，如列之间用逗号分隔。
   调试打印：可以在合并的循环中添加调试打印，例如打印当前文件名(print(filename[i]))，以便于确定出错的文件。
   查看警告：使用warnings()函数查看详细警告，可能会揭示进一步的问题，例如其他列重复或格式错误。