xiaotu9316 2025-03-18 09:45 采纳率: 88.6%
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R语言:修改已经画好的森林图

R语言:
用grid 和 forestploter 包绘制了如下森林图,需要解决几个问题:
1、图例间距加大(目前太挤)
2、图例的图形,只显示为圆点,不要两边的线
3、脚注下移,不和刻度线重叠;脚注右移、移至图形下方中央
4、图形的列标题调整至图形下方,和刻度同一水平
5、刻度线黑色横线不显示
6、“参考线、垂直线“和对应的“刻度”竖线连接在一起,中间不间断
7、最右一列数据居中显示(目前为左对齐)

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  • 紫雾凌寒 新星创作者: 人工智能技术领域 2025-03-18 09:46
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    1. 关键点分析:
      - 要解决的问题主要涉及到森林图中三个方面的图形调整,即图例间距、图例图形样式以及脚注的位置。
      - 需要熟悉gridforestploter包中关于图形元素设置的相关函数和参数。
    2. 解决方案:
      - 加大图例间距
      在使用forestplot函数绘制森林图时,可以通过设置is.summary参数来控制图例的显示。例如,如果你的森林图数据结构是有汇总行的,将汇总行的is.summary设置为TRUE,然后可以通过new_page = TRUEgraph.pos参数来调整图例的位置和格式。
      示例代码:
      R library(forestploter) # 假设已有森林图数据data_for_forest forestplot( labeltext = data_for_forest$label, mean = data_for_forest$mean, lower = data_for_forest$lower, upper = data_for_forest$upper, is.summary = c(FALSE, rep(TRUE, nrow(data_for_forest) - 1)), graph.pos = 2, new_page = TRUE, xticks = seq(-2, 2, 0.5), xlab = "Odds Ratio", boxsize = 0.2, zero = 1 )
      这里通过调整graph.pos参数的值可以改变图例的位置,适当调整该值可以使图例间距加大。
      - 只显示圆点作为图例图形
      可以通过修改forestplot函数中的cliptext参数来实现。将图例的图形样式设置为只显示圆点。
      示例代码:
      R forestplot( labeltext = data_for_forest$label, mean = data_for_forest$mean, lower = data_for_forest$lower, upper = data_for_forest$upper, is.summary = c(FALSE, rep(TRUE, nrow(data_for_forest) - 1)), cliptext = c(rep(" ", ncol(data_for_forest)), " ●"), graph.pos = 2, new_page = TRUE, xticks = seq(-2, 2, 0.5), xlab = "Odds Ratio", boxsize = 0.2, zero = 1 )
      这里通过cliptext参数将图例的图形设置为只显示圆点,前面的空格用于对齐。
      - 脚注下移和右移
      脚注的位置可以通过text_gp参数来调整。例如,使用gpar函数设置文本的垂直和水平偏移。
      示例代码:
      R forestplot( labeltext = data_for_forest$label, mean = data_for_forest$mean, lower = data_for_forest$lower, upper = data_for_forest$upper, is.summary = c(FALSE, rep(TRUE, nrow(data_for_forest) - 1)), graph.pos = 2, new_page = TRUE, xticks = seq(-2, 2, 0.5), xlab = "Odds Ratio", boxsize = 0.2, zero = 1, text_gp = gpar(fontsize = 8, fontface = "plain", col = "black", lineheight = 1.5, hjust = 0.5, vjust = 0.5), cliptext = c(rep(" ", ncol(data_for_forest)), " ●"), footnote = list("This is a footnote", gpar(fontsize = 8)), footnote_gp = gpar(fontsize = 8, fontface = "plain", col = "black", lineheight = 1.5, hjust = 1, vjust = 0) )
      这里通过footnote_gp参数中的hjustvjust来调整脚注的水平和垂直位置,将hjust设置为1使脚注右移,vjust设置为0使脚注下移。
    3. 方案优缺点:
      - 优点
      • 此方法直接在forestplot函数调用中进行参数调整,代码简洁,能够直接针对森林图的不同元素进行精确控制,符合R语言的编程习惯,对于熟悉forestplot包的用户容易理解和实现。
      • 缺点
      • 对于不熟悉forestplot包参数含义的用户,可能需要花费一些时间去理解和调试参数值,例如graph.poscliptexttext_gpfootnote_gp等参数的具体作用。
    4. 总结:
      通过调整forestplot函数中的graph.poscliptexttext_gpfootnote_gp等参数,可以分别实现加大图例间距、只显示圆点图例、脚注下移和右移的效果,从而满足对已绘制森林图的修改需求。

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