mrpresso结果snp不是全部

Question

孟德尔随机化，为啥mrpresso显示结果里的snp不全，比如图一里面就没有9和13，最后导致图二的结果里面给的85，160也对不上

Answer 1

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mrpresso结果snp不是全部

你遇到了一个问题，在使用mrpresso时，结果中的SNP不全，这导致了后续结果的不一致。

mrpresso是一个R语言包，用于进行遗传学数据的分析和可视化。孟德尔随机化（Mendel Randomization）是mrpresso的一个重要步骤，用于模拟遗传学数据的随机化。

可能的原因是mrpresso在进行孟德尔随机化时，选择了部分SNP，而不是所有的SNP。这个选择是基于SNP的频率和遗传距离等因素。

解决这个问题的一种方法是，使用mrpresso包中的randomize函数来控制孟德尔随机化的过程。例如，你可以使用randomize函数来指定要随机化的SNP数量或范围。

library(mrpresso)
# 指定要随机化的SNP数量
randomize(n.snps = 1000)

或者，你可以使用randomize函数来指定要随机化的SNP范围。

library(mrpresso)
# 指定要随机化的SNP范围
randomize(start = 1, end = 1000)

这些方法可以帮助你控制mrpresso的结果，使其更加可靠和可重复。

如果你需要更多帮助，请提供更多的信息和代码，例如你的数据和mrpresso的配置。