保存PDF后，PDF无法打开

Question

求.助，我们用以下代码保存pdf后，无法打开pdf。在文件预览窗口可以看见PDF是正常的，但是打开显示文件损坏。

pdf("E:\\R\\brain\\MER2\\ht1.pdf",width = 8,height = 8)
htout <- netAnalysis_signalingRole_heatmap(cellchat, 
                                           pattern = "outgoing",
                                           signaling = c("CXCL", "CCL"))
print(htout)
dev.off()

Answer 1

阿里嘎多学长整理AIGC生成，因移动端显示问题导致当前答案未能完全显示，请使用PC端查看更加详细的解答过程

问题解决方案

你遇到的问题可能是由于 PDF 文件的编码问题导致的。R 语言使用的 PDF 生成库可能会生成不兼容的 PDF 文件。

可以尝试使用 pdf() 函数的 options() 参数来设置 PDF 文件的编码，例如：

options(repr.plot.width = 8)
pdf("E:\\R\\brain\\MER2\\ht1.pdf", options = list(device = "png"))

这将使用 PNG 设备来生成 PDF 文件，这可能会解决问题。

如果问题仍然存在，可以尝试使用其他 PDF 生成库，例如 reporteRs 或 Officer，它们可能会生成兼容的 PDF 文件。

如果你已经使用 pdf() 函数生成了 PDF 文件，可以尝试使用 pdftools 包来修复 PDF 文件，例如：

library(pdftools)
fix_pdf("E:\\R\\brain\\MER2\\ht1.pdf")

这将尝试修复 PDF 文件中的错误。