windows不支持分叉集群 ​

Question

复现某篇生信论文的代码，出现了这个问题

Error in makeForkCluster(nnodes=spec,...):windows不支持分叉集群 ​

这个R语言的报错要怎么解决

Answer 1

这个错误是因为 makeForkCluster 函数在Windows系统上无法工作，因为Windows系统不支持分叉集群。 makeForkCluster 函数是 parallel 包的一部分，它用于创建一个基于进程的并行计算集群。如果您的系统是Windows，您可以考虑使用其他类型的集群，如 makeCluster 或 makePSOCKcluster。这两个函数创建基于Socket的并行计算集群，可以在Windows上工作。以下是使用 makePSOCKcluster 函数的一个例子：

library(parallel)
cl <- makePSOCKcluster(spec)
# 执行并行计算任务
stopCluster(cl)

这里，spec 是描述集群规格的参数，比如集群中节点的数量等。然后，您可以使用 cl 对象执行并行计算任务。完成任务后，使用 stopCluster(cl) 命令关闭集群。

需要注意的是， makePSOCKcluster 函数在 Windows 和 Unix 系统上的使用方式有一些差别，您可以在 R 的帮助文档中查找具体用法。