R语言 TwoSample MR

Question

已经读入R的数据，想转换成twosample MR的格式，使用format_data（），但是总是报错none of the specified columns present是怎么回事呀？是我原始数据格式不对吗？

Answer 1

该回答引用GPTᴼᴾᴱᴺᴬᴵ
出现"none of the specified columns present"的错误通常是因为在使用format_data()函数时指定的变量名与原始数据中的变量名不一致或者不在原始数据中存在。请确保在使用format_data()函数时正确指定了原始数据中存在的变量名。

下面是一个使用format_data()函数的示例代码：

library(mrrobust)
data("example_data")

# 将原始数据转换为twosample MR格式
twosample_data <- format_data(
  data = example_data,
  exposure = "Exposure",
  outcome = "Outcome",
  covariates = c("Age", "Sex", "PC1", "PC2")
)

# 查看转换后的数据格式
head(twosample_data)

请注意，在使用format_data()函数时，需要指定以下参数：

• data: 原始数据。
• exposure: 暴露变量的名称。
• outcome: 结局变量的名称。
• covariates: 用作调整变量的名称，可以是单个字符串或字符串向量。

请确保指定的变量名称在原始数据中存在，并且没有拼写错误。