输入prefetch -c SRR3589958后下载的数据没有.sra的后缀，也没法转变为fastq,求解决方法，感谢
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heart_6662 2023-01-15 15:07关注望采纳！！！点击回答右侧采纳即可！！
解决方法：- 使用fastq-dump工具将.sra文件转换为fastq文件：
fastq-dump --split-files SRR3589958 - 使用sratoolkit工具将.sra文件转换为fastq文件：
fastq-dump --split-files SRR3589958 --outdir <输出目录>
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分享- 使用fastq-dump工具将.sra文件转换为fastq文件：
- 2022-11-17 20:54回答 2 已采纳 找到一份他人获取样本的网站网址，不知是否适合你？查看样本列表：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra?term=SRP115453【不过已经注明，只可以看到该数据集共有182
- 2019-08-19 17:58回答 2 已采纳 已经明白如何操作，终端目录跳到bin后，直接输入./vdb-config -i,就可以打开页面改变工作地址
- 2023-01-14 21:40回答 1 已采纳 望采纳！！！点击回答右侧采纳即可！ 解决方法： 打开终端，输入以下命令：sudo xattr -r -d com.apple.quarantine /Applications/sratoolkit.2
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- 2022-01-24 23:56回答 10 已采纳 代码私发你了，拿你的6个代码测试通过了
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- 2021-05-15 21:51weixin_28916013的博客 生物或医学中涉及高通量测序的...并在文章末尾标明数据存储位置和登录号,如The data from this study was deposited in NCBI Sequence Read Archive under accession SRA: SRP114962.。NCBI的SRA (Sequence Read ...
- 2021-05-10 07:08EditSprings论文润色的博客 Minus_yao 2018.04.25 yaoguocai_cool@163.com#从NCBI下载SRA数据,最近在疯狂下载宏基因组数据，试着解决一下这个问题~方法一：软件准备：使用ncbi提供的下载工具sratoolkit，下载到本地服务器上Wgethttps://ftp-...
- 2021-05-12 14:43weixin_39638929的博客 做为一个合格的生物信息菜鸟，没钱测序咋整，...1、简介SRA(Sequence ReadArchive)数据库是用于存储二代测序的原始数据，包括 454，Illumina，SOLiD，IonTorrent，Helicos 和 CompleteGenomics。除了原始序列数据外...
- 2021-05-12 14:42萌萌的微微哟的博客 参考链接：https://www.jianshu.com/p/680e8d7205161. 下载Aspera Connect：在命令行输入如下命令wget http://download.asperasoft.com/download/sw/connect/3.7.4/aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.tar.gz2. ...
- 2021-05-15 21:50小头影视的博客 一、测试环境及工具Linux(Ubuntu 18.04.1)Aspera (Aspera Connect version 3.9.9.177872)image二、Aspera 下载imagewget 下载：wget ...
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