R stripchart

Question

R 遇到的问题
代码

bp=stripchart(veg$Transect~veg$R,method="jitter",ylim=c(0,20),pch=21)
points(vegmean-4,pch=22)
问题
points画的点比其数值高4左右，猜测可能的原因是Stripchart画图时发生了Y轴的缩进，即0，4区域被自动缩小了
手动设置ylim后问题依旧存在

求解原理和解决方法

Answer 1

引用自chatgpt
stripchart()函数会在y轴上对观测值进行抖动(jitter)，这可能会导致数据点相对于y轴有一些偏移。而points()函数在默认情况下使用的是坐标轴值，而不是数据值。因此，当您使用points()函数时，如果不将数据值转换为相应的坐标轴值，可能会导致点的位置出现偏移。

解决此问题的一种方法是，使用plot()函数而不是stripchart()函数，这样可以明确设置x轴和y轴的范围，而不是让函数自动调整。如果您仍然想使用stripchart()函数，您可以手动计算每个数据点的坐标轴值，并将其传递给points()函数。您可以使用axis()函数获取当前的坐标轴范围，并使用transformr()函数将数据值转换为坐标轴值。

例如，以下代码可以将数据点的值转换为相应的坐标轴值并将其传递给points()函数：
bp = stripchart(veg$Transect ~ veg$R, method="jitter", ylim=c(0,20), pch=21)
axis_range = axis(2)
points(transformr(vegmean-4, from=c(min(vegmean-4), max(vegmean-4)), to=axis_range), pch=22)
这将使用axis()函数获取当前的y轴范围，然后使用transformr()函数将vegmean-4的值从数据值转换为相应的坐标轴值，并将其传递给points()函数。