t-SNE数据可视化与标准化/归一化的顺序问题

Question

在做高维数据t-SNE可视化的时候，是否需要先将数据进行归一化处理再进行t-SNE可视化？还是说先进行t-SNE可视化之后进行归一化处理？是否有数学依据？

Answer 1

在进行高维数据的t-SNE可视化时，建议先将数据进行归一化处理，然后再进行t-SNE可视化。

归一化可以使得不同维度的特征值具有相同的尺度，避免某些维度的特征值过大而影响到t-SNE的计算。此外，归一化还可以加快t-SNE的计算速度和提高可视化效果。

具体来说，t-SNE算法的核心是将高维数据映射到低维空间中，并保留数据点之间的局部相似性。如果数据未经过归一化处理，则不同维度之间的尺度差异会对相似性度量产生影响，从而导致可视化效果不佳。

因此，建议在进行t-SNE可视化前，先对数据进行归一化处理。一般可以采用z-score标准化或者将数据缩放到[0, 1]范围内等方法进行归一化。

需要注意的是，在进行归一化处理后，数据的原始分布信息可能会受到影响。因此，有时候也可以先进行t-SNE可视化，然后再对可视化结果进行归一化处理。但这种方法需要谨慎使用，并根据具体情况进行调整。

总之，数据归一化和t-SNE可视化是相互依存的，二者都可以影响到可视化结果。具体的处理方法需要结合实际情况进行选择。