如何运行这个分割模型

Question

请问一下，如何成功的在自己的电脑上成功运行这个医疗影像分割模型啊，求十分具体的步骤，谢谢
https://github.com/HiLab-git/LCOVNet-and-KD

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这是最后一次调试出现的问题，求指教

Answer 1

github仓库已经有对应步骤，
但是比较简单好多细节没有提到。
.

这边下载到本地试了下，补充了下具体需要操作的部分，
下面是需要的具体操作 以及最后 github上的操作步骤：

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这个是需要本地运行的所有步骤

1、下载

• 下载仓库

git clone https://github.com/HiLab-git/LCOVNet-and-KD.git 

• 下载网盘

https://pan.baidu.com/share/init?surl=HwD1iqHorgXfYXnrChdzIg
9jlj
下载后 放到 

• 网盘文件放置

teacher.model
teacher.model.pkl 
拷贝到 
LCOVNet-and-KD/for_tmi/KD/ 文件夹下

2、安装

• 安装第三方库

  对于CUDA 11

python3 -m pip install PYMIC torch torchvision torchaudio ml_collections einops  timm monai -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple

对于CUDA 10.1

python3 -m pip install torch==1.9.0+cu101 torchvision==0.10.0+cu101 torchaudio==0.9.0 ml_collections einops  timm monai  -f https://download.pytorch.org/whl/torch_stable.html -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple

3、修改配置

• 修改路径为本地路径

/home/data/zhaoqianfei/new_pymic
全局替换为->
你的本地路径/LCOVNet-and-KD

4、运行

• ubuntu下运行

cd LCOVNet-and-KD
python3 pymic/net_run/train.py for_tmi/KD/config/kd.cfg

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补充：

github上面的步骤：

使用步骤

• 1、安装PyMIC:
  https://github.com/HiLab-git/PyMIC

  python3 -m pip install PYMIC
  

  并将文件添加到 Pymic。

• 2、 从百度网盘:
  https://pan.baidu.com/share/init?surl=HwD1iqHorgXfYXnrChdzIg
  下载预训练模型和示例CT图像（提取码9jlj）。

• 3、运行./KD/run.sh。结果将保存在./KD/model/kd.

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