统计如下路径每个子目录内in.fa文件序列数量
/mnt/sdb/share/bin/linux-demo/file3/*/in.fa
结果参考:/mnt/sdb/share/bin/linux-demo/file3/seq.stat.xls
命令提示:grep / awk / sed
结果参考:/mnt/sdb/share/bin/linux-demo/file3/seq.stat.xls
命令提示:grep / awk / sed
【以下回答由 GPT 生成】
首先,题目要求统计指定路径下每个子目录内的in.fa文件序列数量,路径为/mnt/sdb/share/bin/linux-demo/file3/*/in.fa
。可以使用find
命令来查找符合条件的文件,然后再使用其他命令处理结果。
以下是一个使用find
和wc
命令的解决方案:
find
命令查找符合条件的文件,并使用管道将结果传递给后续命令:find /mnt/sdb/share/bin/linux-demo/file3 -type f -name 'in.fa' | ...
wc
命令统计文件的行数,每行代表一个序列。使用-l
选项可以只显示行数,而不显示文件名称。同样使用管道将结果传递给其他命令:find /mnt/sdb/share/bin/linux-demo/file3 -type f -name 'in.fa' | wc -l
awk
命令来处理结果。首先,将结果输入给awk
命令,然后使用awk
脚本来分类统计,最后输出结果到一个文件。find /mnt/sdb/share/bin/linux-demo/file3 -type f -name 'in.fa' | awk -F/ '{a[$(NF-1)]++} END{for(i in a) print i, a[i]}' > /mnt/sdb/share/bin/linux-demo/file3/seq.stat.xls
解释一下awk
脚本的逻辑:
- -F/
选项指定以/
为分隔符,将每行的字段分割成数组。
- $(NF-1)
表示倒数第二个字段,即子目录的名称。
- a[$(NF-1)]++
将子目录的名称作为索引,每次出现一次自增1。
- END{for(i in a) print i, a[i]}
表示在结束时输出每个子目录的名称和出现的次数。
通过上述步骤,可以实现统计每个子目录内的in.fa文件序列数量。将结果保存到/mnt/sdb/share/bin/linux-demo/file3/seq.stat.xls
文件中。
请注意,以上解决方案仅适用于Linux系统中的任务。