孟德尔随机化提取在线GWAS暴露结局变量时

Question

孟德尔随机化运行TwoSampleMR包提取在线暴露变量或结局变量时
出现

> chd_out_dat <- extract_outcome_data(snps = bmi_exp_dat$SNP, outcomes = 'ieu-a-7')
Extracting data for 30 SNP(s) from 1 GWAS(s)
Error in ieugwasr::associations(variants = snps, id = outcomes, proxies = proxies,  : 
  参数没有用(access_token = access_token)

安装了论坛中所说的MRCIEU/ieugwasr@v0.2.1包也还是一直出现

access_token = access_token

Answer 1

该回答引用自GPT-3.5,由博主GISer Liu编写：

问题分析：
根据报错信息，可以看出问题出在access_token这个参数上，似乎在使用extract_outcome_data函数时需要提供access_token参数，但是在你的代码中没有提供该参数，导致报错。解决方案如下：
解决方案：
1.查看函数说明文档：首先，应该查看extract_outcome_data函数的说明文档，确认该函数是否需要提供access_token参数，以及如何正确提供该参数。
2.提供access_token参数：如果确实需要提供access_token参数，那么在调用extract_outcome_data函数时，应该提供正确的access_token参数。你可以通过查看相关文档或寻求帮助来获取正确的access_token值。
3.更新ieugwasr包：如果你已经安装了最新版本的``` MRCIEU/ieugwasr

4.联系开发者：如果以上方法都无法解决问题，可以尝试联系``` ieugwasr ```包的开发者，反馈你遇到的问题，看是否能得到进一步的帮助和解决方案。
具体代码修改如下：
RCopy code

chd_out_dat <- extract_outcome_data(snps = bmi_exp_dat$SNP, outcomes = 'ieu-a-7', access_token = 'your_access_token')

请将 'your_access_token' 替换为你实际的 access_token ```值。
希望这些解决方案能帮到你！

如果该回答解决了您的问题，请采纳！如果没有，请私信联系或评论您的疑惑