关于caffe修改源码和编译的疑问

配置完caffe之后，最近想做一件事情，就是我想对制作lmdb文件的过程做一点修改，所以我打算改一下原来的convert_imageset.cpp文件，并重新编译生成可执行文件convert_imageset。
首先，我尝试着用：
g++ convert_imageset.cpp -o convert_imageset
编译，这时候终端提醒的错误是：
convert_imageset.cpp:22:29: fatal error: caffe/util/db.hpp: 没有那个文件或目录 #include "caffe/util/db.hpp"
意识到是头文件的问题，那我就重新试了一下：
g++ convert_imageset.cpp -o convert_imageset -I/home/lichenyang/caffe/include
结果出现了下面的错误：
/home/lichenyang/caffe/include/caffe/util/device_alternate.hpp:34:23: fatal error: cublas_v2.h: 没有那个文件或目录 #include <cublas_v2.h>
这个我估计是CPU和GPU的问题。

    我的显卡是A卡，当时在配置caffe的时候修改了Makefile.config，将CPU_ONLY := 1的注释去掉了，caffe的配置也没有出错。

所以我的疑问是：如果我想对caffe的某个.cpp文件进行修改（比如：convert_imageset.cpp），那么我在修改完成之后，应该如何正确变编译出可执行文件？有没有大神能够指点一下，或者提供一下这方面的博文，感激不尽！