看到一篇文献,作者用质谱得到的一堆分子数据画了这么一张图。
表达的意思大致是样品中分子元素种类的分布和丰度状态。
原文地址:
Metagenomic evidence for the microbial transformation of carboxyl-rich alicyclic molecules: A long-term macrocosm experiment - ScienceDirect
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0043135422002445#!
数据大概这样:
C | H | N | O | S | theo | m/z | intensity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
17 | 21 | 2 | 7 | 367.1396702 | 367.13981 | 560558937 | |
18 | 23 | 8 | 367.1398404 | 367.13981 | 560558937 |
有几个疑问:
1.多维数据如何展现为上图的雷达散点图?
2.图名为kernel density plot,但我查阅了sns中的kdeplot相关资料,最多看到将核密度图二维展示的情况,如何做到上图的效果。而且上图的z轴是intensity,就是数据表中的最后一项,这和核密度有什么关系?