类似于这样的数据怎么用R语言操作将样本分成两组（cluster1和cluster2）
列如：cluster1（gene1低表达；gene2高表达）；cluster2（gene1高表达；gene2低表达）
TCGA样本分组 R语言
类似于这样的数据怎么用R语言操作将样本分成两组（cluster1和cluster2）
列如：cluster1（gene1低表达；gene2高表达）；cluster2（gene1高表达；gene2低表达）
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- 2021-10-10 21:37回答 2 已采纳 提示错误是第6583行没有425个元素。可能是数据残缺，也可能是该行的分隔符有问题。检查一下原始数据，并作出相应修改。如有帮助，请点击采纳按钮给予采纳~~
- 2021-04-10 23:16回答 3 已采纳 可能是下载的数不完整，或者数据存放路径有问题。建议先将dataPath这个部分代码注释掉，这样来写： BiocManager::install("TCGAbiolinks") library(TC
- 2021-09-17 12:03回答 1 已采纳 需要对点号进行转义。参考代码如下： e<-'TCGA.2J.AAB1' f<-gsub('\\.','-',e) print(f) #output:"TCGA-2J-AAB1"
- 2023-02-28 18:13回答 2 已采纳 基于Monster 组和GPT的调写：在R中使用na.omit()函数时，它会删除包含缺失值的行并返回一个不包含缺失值的数据框。在您的代码中，您没有将结果赋值给新的对象，所以原始数据框被改变并且删除了
- 2021-11-14 22:48回答 4 已采纳 看仔细了，getDiffExpressedGenes这个函数里面，dataObject@RNASeq2GeneNorm可能是一个空的量，所以dim出来也都是0
- 2023-03-01 10:27回答 1 已采纳 一眼光俊，这个出结果是有条件的(pValue<0.01) & (roc$AUC[2]>0.68) & (pValueTest<0.05) & (rocTest$AUC[2]>0
- 2023-03-01 12:02回答 2 已采纳 基于Monster 组和GPT的调写：看起来是绘图时的一个坐标轴问题。由于 Cox 回归模型中某个变量可能具有无限的系数，因此在绘图过程中出现了这个问题。此外，在警告信息中，coxph 函数也提示您在
- 2023-03-17 23:48回答 5 已采纳 参考GPT和自己的思路：这个错误提示说明你尝试使用cbind函数合并数据时，发现有些矩阵的行数不一致，无法进行合并。根据你的代码，我猜测这个问题可能是由于不同的xml文件中，数据的列数不同所导致的。
- 2023-03-09 15:48回答 1 已采纳 小魔女参考了bing和GPT部分内容调写:使用GEO数据和TCGA模型筛选出的预后基因，可以对这些基因的表达量进行分析，以验证TCGA模型的准确性。可以通过比较GEO数据库和TCGA数据库中基因的表达
- 2023-02-19 23:00回答 8 已采纳 该回答引用ChatGPT 有可能是由于两个数据集的差异性导致的。虽然两个数据集都是肝癌数据，但是不同的实验条件、处理方法、测序平台等都会导致基因表达的差异。在使用外部验证数据集时，可以进行以下步骤来
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