使用conda安装fastqc时报错

Question

使用conda安装fastqc时报错，但我明明是配置了镜像的啊，不理解。或者有没有其他安装fastqc的方法呢，就是用wget安装的貌似安装包损坏了

Answer 1

以下回答引用自chatGpt, 有用的话，请采纳哇！！！

可能是conda的配置文件没有更新，可以尝试使用以下命令更新一下配置文件：

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes

然后再尝试安装fastqc：

conda install fastqc

如果还是不行，可以尝试手动下载fastqc安装包，然后解压缩并设置环境变量：

wget https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.11.9.zip
unzip fastqc_v0.11.9.zip
cd FastQC
chmod 755 fastqc
export PATH=$PATH:/path/to/FastQC

其中，/path/to/FastQC是fastqc所在的路径。