多个自变量和因变量回归结果FDR校正问题

Question

我有7个自变量和11个因变量，最终得到77个P值，想问一下在用p.ajust做FDR校正时是要把77个全放进去吗，还是需要按因变量分组进行，每次放进去7个P值。

Answer 1

引用 皆我百晓生 小程序回复内容作答：
在进行FDR校正时，你应该将所有的77个P值放在一起进行校正。FDR校正是用来控制错误发现率的，它帮助我们确定哪些P值较小的结果是真正的显著。

根据你的情况，你有7个自变量和11个因变量，最终得到77个P值。FDR校正是用来校正整体的P值列表，而不是根据因变量分组。因此，你应该将所有77个P值放在一起，然后对它们进行FDR校正，以控制整体错误发现率。

在R语言中，你可以使用p.adjust函数来对P值进行FDR校正。示例代码如下：

# 假设P值存储在一个向量p_values中
adjusted_p_values <- p.adjust(p_values, method = "fdr")

这样，adjusted_p_values将会是FDR校正后的P值列表。

需要注意的是，FDR校正是将P值进行排序，然后根据排序后的顺序进行校正。因此，你应该确保将所有的P值放在一起进行校正，而不是分组校正。这样可以更准确地控制整体错误发现率。