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qiufengqwsa
2022-06-25 15:48
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运维
已结题
生信分析,从基因组里面找结构域
系统架构
问题遇到的现象和发生背景 想在基因组里面找到含有特定结构域的蛋白的基因,不知道如何操作
问题相关代码,请勿粘贴截图
运行结果及报错内容
我的解答思路和尝试过的方法
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生信
TCGA差异基因
分析
getDiffExpressedGenes报错
r语言
有问必答
2021-11-14 22:48
回答 4
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看仔细了,getDiffExpressedGenes这个函数
里面
,dataObject@RNASeq2GeneNorm可能是一个空的量,所以dim出来也都是0
求大家推荐一些
生信
入门课程
database
r语言
2022-10-22 17:31
回答 1
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https://www.so.com/link?m=ba0Rtwf0
关于我的毕业论文,没学过
生信
却做着
生信
,论文是离子型受体的鉴定和功能筛选
人工智能
深度学习
神经网络
2022-03-29 16:29
回答 1
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我可以帮你一步一步来
宏
基因组
学Metagenome-磷循环Pcycle功能基因
分析
-从
分析
过程到代码及结果演示-超详细保姆级流程
2023-12-17 13:30
小果运维的博客
磷循环数据库 (PCyCDB),包含 138 个基因家族和 10 个代谢过程。将同源基因添加到数据库中,以降低假阳性率。通过识别已知的模拟基因数据集和模拟细菌群落,对序列相似性搜索工具(如BLAST、USEARCH、DIAMOND)...
生信
:conda安装的软件无法调用。
linux
python
vim
2021-08-08 16:09
回答 1
已采纳
首先我用你贴的命令执行之后,也没安装成功 如果你确定安装成功的话,安装下面的步骤进行排查 检查 busco 是否安装成功 pip list| grep busco检查是否生成执行文件 l
使用Huttenhower的web Galaxy平台进行LefSe
分析
,第二步就报错。
python
有问必答
2021-06-09 14:47
回答 5
已采纳
问题解决!让人哭笑不得…… 我的数据文件表头第一行为主分类Class 第二行为子分类Subclass 第三行为样本名称SampleID 第四行开始为数据内容 由于是第一次
分析
,我不太确定子分类对结
这个程序为什么运行出来是空的呀
c语言
2021-11-23 15:53
回答 2
已采纳
因为你的n没有赋值,默认就会给它赋值,n=0,程序只是进入第一个循环,当到for(a=2;a<n;a++)的条件中a<n是false,所以不进入第二个循环,就不会执行if-else条件语句
单菌二三代数据组装神器Unicycler-Ragtag连接contig-pyGenomeViz
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2022-10-05 20:24
Neptuneyut的博客
Unicycler是组装细菌
基因组
的软件套装。它既可以使用SPAdes组装纯Illumina短读长的二代数据,也可以使用miniasm+Racon管道组装三代长读长数据(PacBio或Nanopore)。进一步,可以同时给它二代和三代数据,它将进行短...
这为啥运行结果是空的啊,编译也没问题
c语言
链表
2021-10-19 12:36
回答 4
已采纳
```c //代码太多了,眼会花,先改这个创建的函数,改完还有错就继续来 struct space* create(){ //创建链表 int n,i; scanf("%d",
配置~/.bashrc需要注意什么
linux
2022-10-16 09:06
回答 4
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请看👉 :Linux错误修改.bashrc导致常用命令无法使用问题及解决方案记录
windows不支持分叉集群
r语言
2023-02-14 17:24
回答 1
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这个错误是因为 makeForkCluster 函数在Windows系统上无法工作,因为Windows系统不支持分叉集群。 makeForkCluster 函数是 parallel 包的一部分,它用于
快速上手
生信
分析
tips
2022-05-18 15:34
拿铁加两泵覆盆子糖浆的博客
今天开始不仅要开始学习叶绿体
基因组
分析
,同时也要带本科生师妹进行入门培养,对于我来说恰好形成了输入-输出闭环,是一个很好的自我提升的机会,因此同步到CSDN上予以记录。 我写的很简单。很多时候事情就是很...
MEGA建树出现这种错误怎么弄啊😭
其他
2022-03-15 21:34
回答 1
已采纳
意思就是说:距离计算失败-距离矩阵无法计算。错误Id是4511(没有为序列对(11,5)
找
到公共站点)。如果你选择了完全删除选项,那么你可能会获得更好的结果使用两两删除选项,因为完全删除删除所有包含任
如何使用步骤简单并可视化的
生信
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软件或者平台-sixclock分享
2021-12-23 17:19
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都及其复杂或者困难,sixclock尽量用简单到拖拽的比较简单的界面和步骤来进行数据
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。 后面会详细解释sixoclock的运作机制,并结合一个案例展示通过sixoclock处理数据的...
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2023-02-03 23:15
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工具-MetaPhlAn4安装和使用方法-Anaconda3- centos9 stream
2023-10-26 23:15
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MetaPhlAn 4是一种基于DNA序列的微生物组
分析
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基因组
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生信
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分析
过程实现定时处理,规定代码段执行时间
2023-04-06 13:42
生信与基因组学的博客
在
分析
处理流程中,会遇到一些代码段或命令执行出问题,一致处于未结束的状态,其原因可能使代码执行错误。在这种情况下,我们可以通过以下代码来实现超过规定执行时间的代码,强行结束,继续执行后续的代码。
基于BWA,Bowtie2,Salmon和SAMtools、checkm等工具计算宏
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学序列
分析
中Contigs与Genes在样品中的丰度,多种计算方式和脚本对比(20231217更新)
2023-12-16 06:00
小果运维的博客
计算contigs的丰度一般使用assembly的结果,计算基因风度时一般用prodigal的结果,prodigal结果中建议同时输出蛋白序列和核酸序列文件,基因注释是一般使用diamond需要使用蛋白序列,而这里计算丰度需要与原始核酸...
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6月25日
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