使用ggpubr软件包中ggboxplot报错，图形不对

Question

问题遇到的现象和发生背景

使用ggpubr软件包中ggboxplot报错，图形不对

遇到的现象和发生背景，请写出第一个错误信息

使用ggpubr软件包中ggboxplot报错，图形不对，“time”应该有4个

用代码块功能插入代码，请勿粘贴截图。 不用代码块回答率下降 50%

bxp <- ggboxplot(
  ALT, x = "group1", y = "ALT",
  color = "time", palette = "jco",facet.by = "group2", short.panel.labs = FALSE
)
bxp

运行结果及详细报错内容

Warning messages:
1: The following aesthetics were dropped during statistical transformation:
colour
ℹ This can happen when ggplot fails to infer the correct grouping structure in
the data.
ℹ Did you forget to specify a group aesthetic or to convert a numerical
variable into a factor?
2: The following aesthetics were dropped during statistical transformation:
colour
ℹ This can happen when ggplot fails to infer the correct grouping structure in
the data.
ℹ Did you forget to specify a group aesthetic or to convert a numerical
variable into a factor?
3: The following aesthetics were dropped during statistical transformation:
colour
ℹ This can happen when ggplot fails to infer the correct grouping structure in
the data.
ℹ Did you forget to specify a group aesthetic or to convert a numerical
variable into a factor?

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Answer 1

下午好🌅🌅🌅
本答案参考ChatGPT-3.5

在使用ggpubr软件包中ggboxplot时，出现了图形不对的问题，并且报错显示"“time”应该有4个"。根据报错信息，前面的警告也提示了颜色（color）这个美学要素在统计转换过程中被丢弃了，同时也提示可能是由于ggplot无法正确推断数据的分组结构导致的。

针对这个问题，我们可以采取以下解决方案：

1. 检查数据结构：首先，需要检查使用的数据集，确保数据的分组结构是正确的。确保"时间"（time）这个变量在数据中是正确存在的，并且它的值组合是符合预期的。

2. 指定分组变量：在ggboxplot中，可以使用参数group来指定分组变量，确保ggplot能够正确推断数据的分组结构。可以尝试将"时间"（time）这个变量作为group参数的取值，或者根据实际情况选择合适的分组变量。

3. 转换数值变量为因子：如果"时间"（time）是一个数值变量而不是因子变量，可以将它转换为因子变量，以确保ggplot能够适当地理解和处理它。

4. 修改参数设置：如果以上操作都没有解决问题，可以考虑调整其他参数设置，比如调整颜色（color）的设置、调整分面（facet）的设置等，以确保ggboxplot函数可以正确生成图形。

以下是修改后的代码示例：

# 将"time"转换为因子变量
ALT$time <- as.factor(ALT$time)

# 使用ggboxplot并指定分组变量
bxp <- ggboxplot(
  ALT, x = "group1", y = "ALT",
  fill = "time", palette = "jco", facet.by = "group2", short.panel.labs = FALSE
)
bxp

通过以上调整，可尝试重新生成ggboxplot图形，查看是否能够解决报错和图形不对的问题。