去除连锁不平衡时遇到的警告信息，这会有什么影响吗

Question

In .fun(piece, ...) :
  Duplicated SNPs present in exposure data for phenotype 'exposure. Just keeping the first instance:
rs2323487
rs6563550
rs73180681
rs6563551
rs7324216
rs7337526
rs17055871
rs3764077
rs1107244
rs61946592
rs61946576
rs7995332
rs9603206
rs9594210
rs9603207
rs9603208
rs17055747
rs9594211
rs9603209
rs9603205
rs9594207
rs1322804
rs55963355
rs9603195
rs9594209
rs9603202
rs9603201
rs55796046
rs35308611
rs1923717
rs9603203
rs17055728
rs1923718
rs34027519
rs2224659
rs56406841
rs9594208
rs4436664
rs11841382
rs1590303
rs1590305
rs1923719
rs35078720
rs9603204
rs4514540
rs4578521
rs7988812
rs7329262
rs1575383
rs5000542
rs7994056
rs9594205
rs9805695
rs1575381
rs4575409
rs1575382
rs7989845
rs9603200
rs4435115
rs17055723
rs4421867
rs7140071
rs1923716
rs7334359
rs1575380
rs7335244
rs9594206
rs55903929
rs56098078
rs5010916
rs9594204
rs9603191
rs11729256
rs4936098
rs113634144
rs9349825
rs56161035
rs11252894
rs74542928
rs2169719
rs12416161
rs77055143
rs12498518
rs2602429
rs112769434
rs12501826
rs59317921
rs [... truncated]

Answer 1

引自免费微信小程序：皆我百晓生

您好，根据您提供的信息，您在R语言中遇到了一个警告信息，提示数据集中存在重复的SNP（单核苷酸多态性）。这可能会对您的分析产生影响，因为重复的SNP可能会导致一些统计测试的偏差。

要解决这个问题，您可以使用removeDuplicates()函数来删除重复的SNP。下面是一个简单的示例代码，可以帮助您去除重复的SNP：

# 读取数据
data <- read.table("data.txt", header = TRUE)

# 去除重复的SNP
data <- removeDuplicates(data, by="rsid")

# 重新读取数据，查看是否去除 duplicates成功
head(data)

这个代码将会读取一个名为“data.txt”的文件，删除重复的SNP，并将删除后的数据重新写入到“data”变量中。最后，通过head()函数查看去除重复的SNP后的数据。

如果您需要进一步的帮助，或者有其他问题，请随时告诉我。