贝叶斯核机器回归(BKMR)的混杂因素

Question

请问在R语言中使用BKMR的时候，遇到混杂因素是无序多分类变量，是否需要变成多个哑变量进入模型（因为我直接将多分类变量as.factor的话，软件会报错，说要numeric）?

Answer 1

在R语言中使用BKMR模型，遇到混杂因素是无序多分类变量时，应该将其转化为哑变量（dummy variables）。一般来说，将一个无序多分类变量转化为哑变量，需要将其转化为n-1个二元变量，其中n为无序多分类变量的类别数。

在R语言中可以使用dummyVars()函数来实现转化，如下所示：

library(BKMR)
library(caret)
dummy_vars <- dummyVars( ~ factor_variable, data = dataset)

然后使用predict()函数来生成哑变量

dummy_data <- predict(dummy_vars, newdata = dataset)

最后使用生成的哑变量作为新的自变量输入到BKMR模型中进行分析

bkmr_model <- bkmr(dependent_variable ~ ., data = dummy_data)